格微®甄选--16S/18S FISH探针商品目录
来源: | 作者:格微生物 | 发布时间: 2024-08-27 | 4241 次浏览 | 🔊 点击朗读正文 ❚❚ | 分享到:

16S和18S rRNA序列是细菌/古菌和真核生物领域成员的首选靶标,因为它们普遍存在且高度丰富由高度保守的区域和可变区域组成FISH技术利用这些基因序列设计特异性探针,能够精确地定位和识别目标微生物为微生物群落结构分析、生态功能研究以及疾病诊断等领域提供了强有力的工具。


FISH检测的实验流程图:

微基生物16S/18S FISH探针设计:


探针设计确实是一个关键步骤,可以影响FISH的性能。微基生物携手格微生物经过几年研发,专为16S/18S FISH探针设计搭建了格微®甄选平台提供专业、系统性的引物设计与评测。微基生物推出的格微®甄选 菌种特异性16S/18S FISH探针设计、合成及检测服务,将为为科研工作者提供无与伦比的16S/18S FISH探针实验体验。


微基生物已设计完成了100多种微生物“菌种”水平的16S / 18S FISH探针产品,涵盖了多种微生物目标,能够满足不同研究领域的需求。

我们提供个性化产品定制服务,欢迎致电咨询详情:021-50763698。


部分16S / 18S FISH探针商品目录


序号目录号目标菌群 中文名称拉丁文名分类级别整体小结
1G16F1-taxID1716棒状杆菌属Corynebacteriumgenus单探针覆盖率82.05%,双探针覆盖率97.23%
2G16F2-taxID1578乳杆菌属Lactobacillusgenus单探针覆盖率87%,双探针覆盖率97.73%
3G16F3-taxID286假单胞菌属Pseudomonasgenus单探针覆盖率90.10%,双探针覆盖率97.23%
4G16F4-taxID13687鞘氨醇单胞菌属Sphingomonasgenus单探针覆盖率91.99%,双探针覆盖率98.07%
5G16F5-taxID1622小鼠乳酸杆菌Lactobacillus murinusspecies单探针覆盖率100%
6G16F6-taxID135858链状菌属Catenibacteriumgenus单探针覆盖率92.31%,双探针覆盖率100%
7G16F7-taxID2104肺炎支原体Mycoplasmoides pneumoniaespecies单探针覆盖率100%
8G16F8-taxID33038瘤胃球菌[Ruminococcus] gnavus groupspecies单探针覆盖率91.2%,双探针覆盖率97.6%
9G18F9-taxID4929吉氏梅耶酵母Meyerozyma guilliermondiispecies单探针覆盖率9.33%,双探针覆盖率100%
10G16F10-taxID469不动杆菌属Acinetobactergenus单探针覆盖率91.03%,双探针覆盖率94.64%
11G16F11-taxID418240韦氏布劳提菌Blautia wexleraespecies单探针覆盖率100%
12G16F12-taxID1763分枝杆菌属Mycobacteriumgenus单探针覆盖率89.12%,双探针覆盖率97.14%
13G18F13-taxID5477白念珠菌[Candida] boidiniispecies单探针覆盖率100%
14G16F14-taxID33053粉红奈瑟菌Neisseria perflavaspecies单探针覆盖率91.67%,双探针覆盖率100%
15G16F15-taxID1396蜡样芽孢杆菌Bacillus cereusspecies单探针覆盖率91.31%,双探针覆盖率97.24%
16G16F16-taxID1505索氏梭菌Paeniclostridium sordelliispecies单探针覆盖率92.59%,双探针覆盖率92.30%
17G16F17-taxID851具核梭杆菌Fusobacterium nucleatumspecies单探针覆盖率89.05%,双探针覆盖率100%
18G16F18-taxID1694假长双歧杆菌Bifidobacterium pseudolongumspecies单探针覆盖率100%
19G16F19-taxID38313海藻希瓦氏菌Shewanella algaespecies单探针覆盖率90.70%,双探针覆盖率97.67%
20G16F20-taxID24腐败希瓦氏菌Shewanella putrefaciensspecies单探针覆盖率87.5%,双探针覆盖率92.19%
21G16F21-taxID40215嗜胶菌属菌俊尼氏菌Acinetobacter juniispecies单探针覆盖率85.25%,双探针覆盖率93.44%
22G16F22-taxID1313肺炎链球菌Streptococcus pneumoniaespecies单探针覆盖率89.61%,双探针覆盖率92.58%
23G16F23-taxID492670贝莱斯芽孢杆菌Bacillus velezensisspecies单探针覆盖率90.07%,双探针覆盖率97.88%
24G16F24-taxID58231中间螺旋体菌Treponema mediumspecies单探针覆盖率100%
25G16F25-taxID301302粪罗斯氏菌Roseburia faecisspecies单探针覆盖率100%
26G16F26-taxID820单形拟杆菌Bacteroides uniformisspecies单探针覆盖率90%,双探针覆盖率100%
27G16F27-taxID28135口炎普雷沃菌Prevotella orisspecies单探针覆盖率100%
28G16F28-taxID244366栖异地克雷伯氏菌Klebsiella variicolaspecies单探针覆盖率94.07%,双探针覆盖率97.04%
29G16F29-taxID489多糖奈瑟菌Neisseria polysacchareaspecies单探针覆盖率85.71%,双探针覆盖率100%
30G16F30-taxID90371肠沙门氏菌肠亚种鼠伤寒血清型Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimuriumno rank单探针覆盖率96.28%,双探针覆盖率97.02%
31G16F31-taxID316435大肠杆菌Nissle 1917Escherichia coli Nissle 1917strain单探针覆盖率88.24%,双探针覆盖率100%
32G16F32-taxID453840潮栖阿利霍夫莱菌Aliihoeflea aestuariispecies单探针覆盖率100%
33G16F33-taxID1747痤疮丙酸杆菌Cutibacterium acnesspecies单探针覆盖率88.61%,双探针覆盖率96.20%
34G16F34-taxID1679长双歧杆菌长亚种Bifidobacterium longum subsp.longum Reutersubspecies单探针覆盖率100%
35G16F35-taxID216816长双歧杆菌Bifidobacterium longumspecies单探针覆盖率93.88%,双探针覆盖率96.94%
36G16F36-taxID1522-无害梭菌群[Clostridium] innocuum groupspecies单探针覆盖率84.82%,双探针覆盖率94.64%
37G16F37-taxID1522无害梭菌[Clostridium] innocuumspecies单探针覆盖率85.71%,双探针覆盖率100%
38G16F38-taxID1862672纽约杜波西拉菌Dubosiella newyorkensisspecies单探针覆盖率100%
39G16F39-taxID46124颗粒链球菌Granulicatella adiacensspecies单探针覆盖率100%
40G16F40-taxID210幽门螺杆菌Helicobacter pylorispecies单探针覆盖率97.34%,双探针覆盖率99.11%
41G16F41-taxID484黄染奈瑟菌Neisseria flavescensspecies单探针覆盖率85.71%,双探针覆盖率100%
42G16F42-taxID40324嗜麦芽寡养单胞菌Stenotrophomonas maltophiliaspecies单探针覆盖率86.82%,双探针覆盖率96.90%
43G16F43-taxID239935嗜黏蛋白阿克曼菌Akkermansia muciniphilaspecies单探针覆盖率100%
44G16F44-taxID2100猪鼻支原体Mycoplasma hyorhinisspecies单探针覆盖率100%
45G16F45-taxID573肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniaespecies单探针覆盖率95.64%,双探针覆盖率98.88%
46G16F46-taxID1825023硝态纤细菌候选种Candidatus Nitrosotenuisgenus单探针覆盖率88.24%,双探针覆盖率97.06%
47G16F47-taxID963草生螺杆菌属Herbaspirillumgenus单探针覆盖率91.08%,双探针覆盖率96.82%
48G16F48-taxID2301481未培养的Muribaculaceae细菌uncultured Muribaculaceae bacteriumspecies单探针覆盖率100%
49G16F49-taxID1678双歧杆菌属Bifidobacteriumgenus单探针覆盖率91.10%,双探针覆盖率97.88%
50G16F50-taxID216851粪便菌属Faecalibacteriumgenus单探针覆盖率90.51%,双探针覆盖率98.41%
51G16F51-taxID2767887丽珠乳酸菌属Ligilactobacillusgenus单探针覆盖率94.44%,双探针覆盖率97.34%
52G16F52-taxID84111埃氏菌属Eggerthellagenus单探针覆盖率83.33%,双探针覆盖率86.11%
53G16F53-taxID459786摆动菌属Oscillibactergenus单探针覆盖率93.38%,双探针覆盖率97.63%
54G16F54-taxID470鲍氏不动杆菌Acinetobacter baumanniispecies单探针覆盖率84.51%,双探针覆盖率98.21%
55G16F55-taxID562大肠埃希氏菌Escherichia colispecies单探针覆盖率93.70%,双探针覆盖率99.57%
56G16F56-taxID727流感嗜血杆菌Haemophilus influenzaespecies单探针覆盖率88.10%,双探针覆盖率98.73%
57G16F57-taxID287铜绿假单胞菌Pseudomonas aeruginosaspecies单探针覆盖率91.88%,双探针覆盖率97.15%
58G16F58-taxID1280金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureusspecies单探针覆盖率90.64%,双探针覆盖率97.94%
59G16F59-taxID1532圆形布劳提氏菌Blautia coccoidesspecies单探针覆盖率100%
60G16F60-taxID871665类球布劳特氏菌Blautia faecisspecies单探针覆盖率100%
61G16F61-taxID536633葡萄糖布劳提氏菌Blautia gluceraseaspecies单探针覆盖率100%
62G16F62-taxID53443产氢布劳提氏菌Blautia hydrogenotrophicaspecies单探针覆盖率100%
63G16F63-taxID89014鲁氏布劳提氏菌Blautia lutispecies单探针覆盖率100%
64G16F64-taxID40520欧氏布劳提氏菌Blautia obeumspecies单探针覆盖率83.33%,双探针覆盖率100%
65G16F65-taxID33035产气布劳提氏菌Blautia productaspecies单探针覆盖率100%
66G16F66-taxID871664劳特氏菌Blautia stercorisspecies单探针覆盖率100%
67G16F67-taxID42684丘陵链霉菌Streptomyces collinusspecies单探针覆盖率89.47%
68G16F68-taxID28125双路普雷沃菌Prevotella biviaspecies单探针覆盖率88.89%,双探针覆盖率100%
69G16F69-taxID329854肠道拟杆菌Bacteroides intestinalisspecies单探针覆盖率100%
70G16F70-taxID43768马氏棒状杆菌Corynebacterium matruchotispecies单探针覆盖率100%
71G16F71-taxID564弗格森埃希菌Escherichia fergusoniispecies单探针覆盖率97.14%,双探针覆盖率100%
72G16F72-taxID1485梭菌属Clostridiumgenus单探针覆盖率100%
73G16F73-taxID1926283爱德华梭菌Lachnoclostridium edouardispecies单探针覆盖率100%
74G16F74-taxID496猕猴奈瑟菌Neisseria macacaespecies单探针覆盖率100%
75G16F75-taxID158822尼特氏菌M006株Cedecea neteri strain M006species单探针覆盖率100%
76G16F76-taxID230143斯卡多维亚菌Scardovia wiggsiae DSM22547species单探针覆盖率100%
77G16F77-taxID3068309瘤胃球菌科UCG-005Ruminococcaceae bacterium UCG-005species单探针覆盖率81.74%,双探针覆盖率91.82%
78G16F78-taxID1598雷特氏乳酸菌CICC 6132株Lactobacillus reuteri CICC 6132strain单探针覆盖率100%
79G16F79-taxID29546胞内劳森菌Lawsonia intracellularisspecies单探针覆盖率100%
80G16F80-taxID837牙龈卟啉单胞菌Porphyromonas gingivalisspecies单探针覆盖率98.97%
81G16F81-taxID2702阴道加德纳菌Gardnerella vaginalisspecies单探针覆盖率94.44%,双探针覆盖率100%
82G16F82-taxID147802惰性乳酸杆菌Lactobacillus inersspecies单探针覆盖率100%
83G16F83-taxID528苍白杆菌属Ochrobactrumgenus单探针覆盖率92.07%,双探针覆盖率95.47%
84G16F84-taxID39486长链多尔氏菌Dorea formicigeneransspecies单探针覆盖率100%
85G16F85-taxID28139小梭文肯菌Rikenella microfususspecies单探针覆盖率100%
86G16F86-taxID43675粘滑罗氏菌Rothia mucilaginosaspecies单探针覆盖率94.12%,双探针覆盖率100%
87G16F87-taxID35832双叶菌属Bilophilagenus单探针覆盖率91.67%,双探针覆盖率95.83%
88G16F88-taxID872脱硫弧菌属Desulfovibriogenus单探针覆盖率81.05%,双探针覆盖率97.89%
89G16F89-taxID292800普劳氏黄酮分解菌Flavonifractor plautiispecies单探针覆盖率85.71%,双探针覆盖率100%
90G16F90-taxID92488内生潘托菌Pantoea endophyticaspecies单探针覆盖率100%
91G16F91-taxID435590普通类杆菌 ATCC 8482Bacteroides vulgatus ATCC 8482strain单探针覆盖率85.71%,双探针覆盖率100%
92G16F92-taxID1673609阿尔本斯不动杆菌Acinetobacter albensisspecies单探针覆盖率100%
93G16F93-taxID40214约氏不动杆菌Acinetobacter johnsoniispecies单探针覆盖率88.71%,双探针覆盖率93.55%
94G16F94-taxID13690斯菲金戈属Sphingobium yanoikuyaespecies单探针覆盖率96.3%
95G16F95-taxID360807菊粉利用罗斯伯里菌Roseburia inulinivoransspecies单探针覆盖率100%
96G16F96-taxID85831产酸梭菌Bacteroides acidifaciensspecies单探针覆盖率100%
97G16F97-taxID1351粪肠球菌Enterococcus faecalisspecies单探针覆盖率88.52%,双探针覆盖率95.47%
98G16F98-taxID40520肥胖拟杆菌Blautia obeumspecies单探针覆盖率83.33%,双探针覆盖率100%
99G16F99-taxID1827红球菌属Rhodococcusgenus单探针覆盖率91.48%,双探针覆盖率98.43%
100G16F100-taxID964草根螺菌Herbaspirillum seropedicaespecies单探针覆盖率95.24%,双探针覆盖率100%
101G16F101-taxID47678一种肠道拟杆菌Bacteroides caccaespecies单探针覆盖率100%
102G16F102-taxID654韦罗气单胞菌Aeromonas veroniispecies单探针覆盖率97.09%,双探针覆盖率98.84%
103G16F103-taxID853普氏粪肠杆菌Faecalibacterium prausnitziispecies单探针覆盖率90.62%,双探针覆盖率93.75%
104G16F104-taxID1898203乳酸菌科细菌Lachnospiraceae bacteriumspecies单探针覆盖率85.05%,双探针覆盖率94.66%
105G16F105-taxID1265黄面瘤胃球菌Ruminococcus flavefaciensspecies单探针覆盖率88.89%,双探针覆盖率100%
106G16F106-taxID163202阑尾棒状杆菌Corynebacterium appendicisspecies单探针覆盖率100%
107G16F107-taxID796942长口梭菌Stomatobaculum longumspecies单探针覆盖率100%
108G16F108-taxID437897巨单形菌Megamonas funiformisspecies单探针覆盖率100%
109G16F109-taxID28131中间普雷沃菌Prevotella intermediaspecies单探针覆盖率93.65%,双探针覆盖率100%
110G16F110-taxID28112福赛坦纳菌Tannerella forsythiaspecies单探针覆盖率100%
111G16F111-taxID1311无乳链球菌Streptococcus agalactiaespecies单探针覆盖率97.45%,双探针覆盖率100%
112G16F112-taxID221279候选竞争杆菌 ASV2Candidatus Competibacter ASV2genus单探针覆盖率100%
113G16F113-taxID821普通拟杆菌Bacteroides vulgatusspecies单探针覆盖率90.90%,双探针覆盖率95.45%
114G16F114-taxID549聚集肠杆菌Pantoea agglomeransspecies单探针覆盖率90.61%,双探针覆盖率98.12%
115G16F115-taxID34038水生拉恩氏菌Rahnella aquatilisspecies单探针覆盖率95.55%,双探针覆盖率97.77%
116G16F116-taxID103796猕猴桃致病变种丁香假单胞菌Pseudomonas syringae pv. actinidiaeno rank单探针覆盖率98.48%
117G16F117-taxID40323嗜麦芽寡养单胞菌属Stenotrophomonasgenus单探针覆盖率90.71%,双探针覆盖率95.86%
118G16F118-taxID48736拉乌顿菌属Ralstoniagenus单探针覆盖率89.46%,双探针覆盖率96.28%
119G16F119-taxID379根瘤菌属Rhizobiumgenus单探针覆盖率91.96%,双探针覆盖率98.42%
120G16F120-taxID1873小单孢菌属Micromonosporagenus单探针覆盖率93.10%,双探针覆盖率98.10%
121G16F121-taxID41276解磷短波单胞菌Brevundimonas vesicularisspecies单探针覆盖率88.88%,双探针覆盖率100%
122G16F122-taxID824纤细弯曲菌Campylobacter gracilisspecies单探针覆盖率88.88%,双探针覆盖率100%
123G16F123-taxID294荧光假单胞菌Pseudomonas fluorescensspecies单探针覆盖率91.86%,双探针覆盖率96.27%
124G16F124-taxID33035球形布劳特氏菌Blautia coccoidesspecies单探针覆盖率100%
125G16F125-taxID215200拉氏消化链球菌Peptostreptococcus russelliispecies单探针覆盖率100%
126G16F126-taxID1509产孢梭菌Clostridium sporogenesspecies单探针覆盖率100%
127G16F127-taxID1134687密歇根克雷伯氏菌Klebsiella michiganensisspecies单探针覆盖率88.52%
128G16F128-taxID1309变异链球菌Streptococcus.mutansspecies单探针覆盖率96.93%,双探针覆盖率98.97%
129G16F129-taxID354351不解糖假苍白杆菌Pseudochrobactrum asaccharolyticumspecies单探针覆盖率100%
130G18F130-taxID45133可可毛色二孢菌Lasiodiplodia theobromaespecies单探针覆盖率100%



FISH探针荧光标记的选择


下表列出了目前荧光显微镜中常见的4种荧光通道:DAPI、FITC、Texas Red和CY5的滤片波长范围,与其最匹配和兼容的荧光基团种类,同时注明了这些荧光基团的主要应用(如抗体标记、蛋白表达或FISH探针标记):



请注意,这些数值和建议的荧光基团是基于常见的荧光显微镜滤光片设置和荧光染料的特性在实际应用中,建议参考显微镜的用户手册、滤光片制造商的规格以及荧光染料供应商的信息,以确保最佳的荧光信号和成像效果。


FISH探针荧光标记策略推荐(请用户结合实际情况确认):


单种细菌16S FISH标记:

目标菌标记,优先选择标记Texas Red, 兼容CY3

阴性对照:推荐FITC标记             *微基生物FISH服务可免费提供

阳性对照(细菌通用探针):CY5         *微基生物FISH服务可免费提供

DAPI通道染DNA

双色FISH探针标记(同时检测两种菌,或使用两种不同荧光标记的探针检测同一种菌):

阳性对照(细菌通用探针):FITC       *微基生物FISH服务可免费提供

目标菌1:推荐Texas Red,兼容CY3

目标菌2:推荐 CY5

DAPI通道染DNA

此种情况下,如需负对照,需在另一张片子中检测


产品特点


每款探针都经过严格设计和评测,确保高特异性和高覆盖率。

每款探针都附有详细的评测报告,包括特异性、覆盖率和应用建议。

单条FISH探针特异性较差的,通过设计双探针及多条探针提高特异性。


FISH 16S rRNA检测中使用双探针的好处:


增加特异性:由于16S rRNA基因在不同细菌中具有不同的保守区域和可变区域,使用双探针可以同时靶向这些区域,从而提高对目标菌种的特异性识别。

 

提高检测的灵敏度和准确性:双探针可以提供双重确认,减少因单一探针可能的非特异性结合导致的假阳性结果。

 

适用性广泛:双探针FISH技术可以应用于多种微生物的检测,包括细菌、古菌和真菌,使其成为一种多功能的微生物检测工具。

 

有助于微生物群落分析:在微生物群落结构分析中,双探针可以更精确地识别和区分群落中的不同成员,为微生物生态学研究提供重要信息。


欢迎访问我们的网站,了解更多关于16S/18S FISH探针的详细信息,以及如何将这些强大的工具应用到您的研究中。微基生物科技,与您携手共创科研新篇章。


推荐文章
RECOMMEND ARTICLES